Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r80L7N1Z3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r80L7N1Z3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r80L7N1Z3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r80L7N1Z3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms