Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm19965J3QNY8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm19965J3QNY8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms