Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20828J3KMI7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm20828J3KMI7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm20828J3KMI7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gm20828J3KMI7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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