Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cldn20G5E8X0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn20G5E8X0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn20G5E8X0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn20G5E8X0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn20G5E8X0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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