Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trim15G3UY57 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim15G3UY57 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms