Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arid4aF8VPQ2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Arid4aF8VPQ2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms