Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3443F7CCV5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms