Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm28305F6U473 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm28305F6U473 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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