Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef5E9Q7D5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef5E9Q7D5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef5E9Q7D5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef5E9Q7D5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef5E9Q7D5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef5E9Q7D5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef5E9Q7D5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef5E9Q7D5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Arhgef5E9Q7D5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Arhgef5E9Q7D5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Arhgef5E9Q7D5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Arhgef5E9Q7D5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Arhgef5E9Q7D5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef5E9Q7D5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef5E9Q7D5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms