Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nup153E9Q3G8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup153E9Q3G8 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms