Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc171E9Q1U1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc171E9Q1U1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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