Protein–RNA interactions for Protein: E9PUS4

Zfp944, Zinc finger protein 944, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp944E9PUS4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Zfp944E9PUS4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Zfp944E9PUS4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms