Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kpna7C0LLJ0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna7C0LLJ0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms