Protein–RNA interactions for Protein: B2RQT2

Vmn1r5, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r5B2RQT2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r5B2RQT2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms