Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.8 ms