Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp36B1AQJ2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp36B1AQJ2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms