Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
4931406B18RikA2RSL7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931406B18RikA2RSL7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms