Protein–RNA interactions for Protein: A2BI40

Xlr4a, X-linked lymphocyte-regulated 4A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4aA2BI40 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Xlr4aA2BI40 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Xlr4aA2BI40 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms