Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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