Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm16095-201ENSMUST00000128235 253 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 AA645442-201ENSMUST00000156020 285 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm7008-203ENSMUST00000171356 476 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm23550-201ENSMUST00000179003 121 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm25123-201ENSMUST00000179154 121 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm25353-201ENSMUST00000179366 121 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm22992-201ENSMUST00000179496 121 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm25892-201ENSMUST00000179867 121 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm24092-201ENSMUST00000180257 121 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 4931440P22Rik-205ENSMUST00000194448 474 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 AC157085.1-201ENSMUST00000216343 162 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm9309-201ENSMUST00000223537 546 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Lgi1-209ENSMUST00000199812 2262 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpusd2Q149F1 Vmn2r111-201ENSMUST00000092491 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 AC161884.1-201ENSMUST00000225436 2174 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Ptpra-202ENSMUST00000077303 3066 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Zscan4e-201ENSMUST00000166753 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Tmem167b-202ENSMUST00000106622 2752 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Ctage5-217ENSMUST00000176892 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Olfr1366-203ENSMUST00000205976 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Igkv6-14-201ENSMUST00000103394 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Gm25057-201ENSMUST00000157366 88 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Ptpn4-204ENSMUST00000163621 431 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Gm4258-201ENSMUST00000182127 506 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Gm18802-201ENSMUST00000186270 888 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Fam24a-201ENSMUST00000084505 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Kmo-201ENSMUST00000040250 2695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Mef2c-213ENSMUST00000197681 2753 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Psd3-203ENSMUST00000093468 1739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 AC131747.2-201ENSMUST00000226121 1895 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 AC121504.1-201ENSMUST00000221385 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 AC122305.1-201ENSMUST00000214803 3921 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Olfr970-202ENSMUST00000213975 1630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Atf2-205ENSMUST00000112010 4037 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Gm20362-201ENSMUST00000204808 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rpusd2Q149F1 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms