Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr1323-201ENSMUST00000057071 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm42905-201ENSMUST00000196237 1611 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm8989-201ENSMUST00000184782 7275 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm6300-201ENSMUST00000192393 1498 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr506-202ENSMUST00000209296 3228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm15178-201ENSMUST00000132100 472 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm6245-201ENSMUST00000164699 768 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Mir6416-201ENSMUST00000183664 117 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Mrgprb9-ps-201ENSMUST00000188739 892 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm36986-201ENSMUST00000195320 353 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr840-ps1-201ENSMUST00000211827 917 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 AC156798.1-201ENSMUST00000220508 224 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr459-201ENSMUST00000050412 1109 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 E430024I08Rik-208ENSMUST00000223312 1573 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Zfp758-203ENSMUST00000121315 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm37781-201ENSMUST00000194773 3218 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Cyp2j5-201ENSMUST00000030299 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps26-201ENSMUST00000117751 333 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Has2os-203ENSMUST00000165880 638 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm18547-201ENSMUST00000192439 811 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Ighv3-4-201ENSMUST00000193408 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 AC140209.1-204ENSMUST00000226736 739 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
Trim71Q1PSW8 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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