Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E4

Ppp1r17, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 17, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r17Q9Z2E4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppp1r17Q9Z2E4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ppp1r17Q9Z2E4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Ppp1r17Q9Z2E4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ppp1r17Q9Z2E4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms