Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Sema4fQ9Z123 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sema4fQ9Z123 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms