Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0T9

Itgb6, Integrin beta-6, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb6Q9Z0T9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb6Q9Z0T9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb6Q9Z0T9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb6Q9Z0T9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb6Q9Z0T9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb6Q9Z0T9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb6Q9Z0T9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb6Q9Z0T9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb6Q9Z0T9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb6Q9Z0T9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb6Q9Z0T9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb6Q9Z0T9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb6Q9Z0T9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms