Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cldn13Q9Z0S4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms