Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clip2Q9Z0H8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip2Q9Z0H8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip2Q9Z0H8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip2Q9Z0H8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clip2Q9Z0H8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms