Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pmfbp1Q9WVQ0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms