Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sema6cQ9WTM3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms