Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GGA1Q9UJY5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GGA1Q9UJY5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms