Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Copg1Q9QZE5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Copg1Q9QZE5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms