Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Six6Q9QZ28 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Six6Q9QZ28 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Six6Q9QZ28 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Six6Q9QZ28 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Six6Q9QZ28 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Six6Q9QZ28 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Six6Q9QZ28 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Six6Q9QZ28 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Six6Q9QZ28 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Six6Q9QZ28 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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