Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMH7

Neu3, Sialidase-3, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neu3Q9JMH7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Neu3Q9JMH7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms