Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LitafQ9JLJ0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LitafQ9JLJ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms