Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
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Tmod4Q9JLH8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Tmod4Q9JLH8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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Tmod4Q9JLH8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Tmod4Q9JLH8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Tmod4Q9JLH8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Tmod4Q9JLH8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Tmod4Q9JLH8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Tmod4Q9JLH8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Tmod4Q9JLH8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Tmod4Q9JLH8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmod4Q9JLH8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Tmod4Q9JLH8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Tmod4Q9JLH8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Tmod4Q9JLH8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Tmod4Q9JLH8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Tmod4Q9JLH8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmod4Q9JLH8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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