Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Arl6ip1Q9JKW0 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arl6ip1Q9JKW0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arl6ip1Q9JKW0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arl6ip1Q9JKW0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arl6ip1Q9JKW0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arl6ip1Q9JKW0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arl6ip1Q9JKW0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Arl6ip1Q9JKW0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Arl6ip1Q9JKW0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms