Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cyp39a1Q9JKJ9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cyp39a1Q9JKJ9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.2 ms