Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nectin1Q9JKF6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms