Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lmbr1Q9JIT0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms