Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rapgef4Q9EQZ6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rapgef4Q9EQZ6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms