Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rpgrip1Q9EPQ2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpgrip1Q9EPQ2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms