Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fundc1Q9DB70 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms