Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smim23Q9DAL0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smim23Q9DAL0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms