Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Snx5Q9D8U8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx5Q9D8U8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms