Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Jam3Q9D8B7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Jam3Q9D8B7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms