Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Srp19Q9D7A6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms