Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3a3Q9D554 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms