Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc83Q9D4V3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc83Q9D4V3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms