Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf6Q9D4J7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.2 ms