Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mrpl28Q9D1B9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl28Q9D1B9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms