Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc47Q9D024 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc47Q9D024 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms